Producten

Infraroodspectroscopie is gebruikt om substraat-eiwitinteracties in kaart te brengen: de conformationele veranderingen van het sarcoplasmatisch reticulum Ca(2+)-ATPase na nucleotidebinding en ATPase-fosforylering werden gevolgd met behulp van de substraat-ATP- en ATP-analogen (2'-deoxy-ATP, 3 '-deoxy-ATP en inosine 5'-trifosfaat), die werden gemodificeerd op specifieke functionele groepen van het substraat.Modificaties aan de 2'-OH, de 3'-OH en de aminogroep van adenine verminderen de mate van door binding geïnduceerde conformationele verandering van het ATPase, met bijzonder sterke effecten waargenomen voor de laatste twee.Dit toont de structurele gevoeligheid aan van het nucleotide-ATPase-complex voor individuele interacties tussen nucleotide en ATPase.Alle onderzochte groepen zijn belangrijk voor binding en interacties van een bepaalde ligandgroep met het ATPase zijn afhankelijk van interacties van andere ligandgroepen.Fosforylering van het ATPase werd waargenomen voor ITP en 2'-deoxy-ATP, maar niet voor 3'-deoxy-ATP.Er is geen direct verband tussen de mate van conformatieverandering na nucleotidebinding en de snelheid van fosforylering, wat aantoont dat de volledige omvang van de door ATP geïnduceerde conformatieverandering niet verplicht is voor fosforylering.Zoals waargenomen voor het nucleotide-ATPase-complex, hangt de conformatie van het eerste gefosforyleerde ATPase-tussenproduct E1PCa(2) ook af van het nucleotide, wat aangeeft dat ATPase-toestanden een minder uniforme conformatie hebben dan eerder werd verwacht.