Producten

Niet-alcoholische leververvetting (NAFLD) heeft een breed spectrum van ziektetoestanden, variërend van milde steatose gekenmerkt door een abnormale retentie van lipiden in levercellen tot steatohepatitis (NASH) die vetophoping, ontsteking, ballonvorming en afbraak van hepatocyten en fibrose vertoont.Uiteindelijk kan steatohepatitis leiden tot levercirrose en hepatocellulair carcinoom. In deze studie hebben we drie verschillende muizenstammen geanalyseerd, A/J, C57BL/6J en PWD/PhJ, die verschillende graden van steatohepatitis vertonen bij toediening van een 3,5-diethoxycarbonyl -1,4-dihydrocollidine (DDC) bevattend dieet.RNA-Seq genexpressieanalyse, eiwitanalyse en metabole profilering werden toegepast om differentieel tot expressie gebrachte genen/eiwitten en verstoorde metabolietniveaus van muizenlevermonsters na DDC-behandeling te identificeren.Pathway-analyse onthulde verandering van het metabolisme van arachidonzuur (AA) en S-adenosylmethionine (SAMe) op andere routes.Om metabolische veranderingen van het metabolisme van arachidonzuur in het licht van ziekte-expressieprofielen te begrijpen, werd een kinetisch model van deze route ontwikkeld en geoptimaliseerd volgens metabolietniveaus.Vervolgens werd het model gebruikt om in silico-effecten van potentiële medicijndoelen voor steatohepatitis te bestuderen. We identificeerden het AA / eicosanoïdemetabolisme als sterk verstoord in DDC-geïnduceerde muizen met behulp van een combinatie van een experimentele en in silico-benadering.Onze analyse van de metabole route van AA / eicosanoïde suggereert dat 5-hydroxyeicosatetraeenzuur (5-HETE), 15-hydroxyeicosatetraeenzuur (15-HETE) en prostaglandine D2 (PGD2) verstoord zijn in DDC-muizen.We tonen verder aan dat een dynamisch model kan worden gebruikt voor kwalitatieve voorspelling van metabole veranderingen op basis van transcriptomics-gegevens in een ziektegerelateerde context.Bovendien werd vastgesteld dat het SAMe-metabolisme verstoord was door DDC-behandeling.Verschillende genen en enkele metabolieten van deze module vertonen verschillen tussen enerzijds A/J en C57BL/6J en anderzijds PWD/PhJ.