5-jood-2′-deoxycytidine CAS: 54-42-2 98-102% Wit kristallijn poeder
| Catalogus nummer | XD90562 |
| productnaam | 5-jood-2'-deoxycytidine |
| CAS | 54-42-2 |
| Moleculaire formule | C9H11IN2O5 |
| Molecuulgewicht | 354.10 |
| Opslaggegevens | 2 tot 8 °C |
| Geharmoniseerde Tarievencode | 29349990 |
Productspecificatie
| Verschijning | Wit kristallijn poeder |
| Test | 99% |
| Specifieke rotatie | +25 tot +30 |
| Zware metalen | <0,001% |
| Verlies bij drogen | <1,0% |
| Residu op ontsteking | <0,3% |
De voorspelbare 3D-structuur van dubbelstrengs DNA maakt het bij uitstek geschikt als sjabloon voor het bottom-up ontwerp van gefunctionaliseerde op nucleïnezuur gebaseerde actieve sites.We onderzoeken hier het gebruik van een 14-meer DNA-duplex als een steiger voor de precieze en voorspelbare positionering van katalytische functionaliteiten.Gezien de alomtegenwoordige deelname van de op histidine gebaseerde imidazoolgroep aan eiwitherkennings- en katalysegebeurtenissen, werden enkelvoudige histidine-achtige gemodificeerde duplexen onderzocht.Door histamine via een amidebinding aan de C5 van de thyminebase te binden, kan de imidazoolfunctie flexibel in de hoofdgroef worden gepositioneerd.De onderlinge interacties tussen het imidazool en de duplex en de invloed ervan op het imidazolium pKaH worden onderzocht door een enkel gemodificeerd thymine op vier verschillende posities in het midden van de 14mer dubbele helix te plaatsen.Met behulp van NMR en ongeremde moleculaire dynamica wordt een structureel motief vastgesteld waarbij een waterstofbinding wordt gevormd tussen het imidazool en de Hoogste zijde van de guaninebasen van twee naburige GC-basenparen.Het motief draagt bij aan een stabilisatie tegen thermisch smelten van 6°C en speelt een sleutelrol bij het moduleren van de pKaH van de imidazoliumgroep.De algemene kenmerken, vereisten en het generieke karakter van het nieuwe pKaH-regulerende motief worden beschreven.
